Считается довольно разнородным видом — растения, теперь включённые в его состав, ранее относились к самостоятельным видам. После многолетних полевых исследований биологи выделяют четыре разновидности: Cryptocoryne cordata var. Cordata (преимущественно Западная Малайзия), var. Siamensis (южный Таиланд на границе с Малайзией), var. Diderici (центральная часть острова Суматра), var. Grabowskii (остров Борнео). В аквариумистике наиболее популярна разновидность Siamensis. У её селекционной формы с приставкой «Rosanervig» листья имеют светлые прожилки. В ряде источников указывается на сложность выращивания в домашних аквариумах — эта информация заимствована из немецкой литературы, где ранее Криптокорину сердцевидную ошибочно считали Криптокориной Гриффита (Cryptocoryne griffithii), которая как раз с трудом поддаётся нормальному росту в искусственной среде. Истинная Cryptocoryne cordata проста в выращивании.